숫염소의 생식기관은 정소(고환), 정소상체(부고환), 음낭, 정관과 부생식선, 요도 및 음경 등으로 구성되어 있다 (그림 1).

좌우 양쪽의 정소는 난원형으로 음낭에 싸여 항문 바로 밑에 수직으로 위치하며 암염소의 난소와 함께 가장 기본적인 생식기이며, 정자를 생산하고 또한 웅성호르몬을 분비한다. 성숙한 흑염소의 정소는 무게가 40～60g 정도이고, 정소조직 1g은 하루에 2천만마리의 정자를 생산한다.

정소상체는 정소수출관과 접촉하는 기관으로서 두부, 체부 및 미부로 되어 있고, 미부에서 정관과 연결되어 있으며, 정자의 운반, 농축, 성숙, 저장 등의 기능을 갖고 있다. 특히 정소상체 미부는 정자의 생명을 유지하는데 알맞은 조건을 갖추고 있기 때문에 정자를 저장하는 창고의 역할도 한다.

정관은 길이 35～50cm의 긴 관으로서 주위에 있는 정낭선, 전립선, 요도구선 같은 부생식선에서 분비되는 정자를 보호하는 분비액과 정자를 혼합하여 정액을 형성하여 요도로 운반하는 기능을 갖고 있다. 특히 요도구선의 분비액은 교미할 때 요도를 세척하여 정자를 보호한다.

요도와 음경은 오줌이 배설되는 통로인 동시에 정액이 사출되는 통로이다. 특히 음경은 교접기관으로 사정을 하기 위해 발기하면 음경체의 S자형 만곡부가 펴져서 음경이 포피 밖으로 돌출한다.

음낭은 정소를 싸고 있는 주름이 많은 주머니로서 피하에는 지방이 거의 없고, 정소 내의 온도를 조절하도록 되어 있다. 음낭은 더울 때에는 늘어지고, 추울 때에는 위축되어 몸에 달라붙어 정소 내의 온도를 체온보다 4～7℃가 낮도록 하는 냉각기의 역할을 한다.

 

암염소의 생식기관은 난소, 난관, 자궁(자궁각, 자궁체, 자궁경), 질 및 외부생식기로 구성되어 있다 (그림 2).

난소는 콩팥의 뒤쪽에 위치하며 편도형의 선체로 숫염소의 정소와 함께 가장 기본적인 생식기이며, 난자를 생산하는 외분비 기능과 자성호르몬, 황체호르몬을 분비하는 내분비 기능을 동시에 갖고 있다. 난소는 피질과 수질로 되어 있으며, 피질은 각종 발육 단계의 난포가 발달하는 곳이며 황체도 있다. 수질은 많은 혈관, 림프관, 신경 등이 분포되어 난소의 지주조직을 형성한다. 난포에는 보통 1개의 발육 중인 난자가 있으며, 난포는 발달 단계에 따라 원시난포, 제2차난포, 제3차난포 및 배란 직전의 그라프난포로 구분한다. 그라프난포에서 성숙한 난자가 배란되는데, 배란된 자리에는 황체가 형성된다. 황체는 배란 10일 경에 최대의 크기에 달하며 임신되지 않았을 때에는 14일 경부터 퇴행하기 시작하고, 임신이 되었을 때에는 분만한 후에 퇴행한다.

난관은 난소와 자궁을 연결하는 나선상의 관으로서 난관누두부, 난관팽대부, 난관협부로 구분한다. 특히 난관팽대부는 수정이 이루어지는 장소이다.
난관에서 분비되는 난관액은 수정란의 발달에 필요한 영양분을 공급한다.

자궁은 직장과 방광 바로 밑에 있는 긴 관으로 자궁각, 자궁체, 자궁경으로 구분하며, 수정란이 착상하여 태아로 발육 성장하는 곳이다. 자궁의 자궁선에서 분비되는 분비액은 자궁유라고 하고, 발정주기에 따라 분비 기능이 차이가 있는데, 황체기에 가장 많이 분비된다. 자궁유는 수정란이 착상될 때까지 수정란에 영양을 공급하는 역할을 한다.

질은 팽창성을 갖는 교접기관으로 처녀막에 의하여 외음부와 구분된다. 외부생식기는 배뇨기관과 생식기관의 말단이며, 질전정, 대음순, 소음순, 음핵, 전정선 등으로 되어 있다.